翁源县农业农村局是县政府工作部门，为正科级，加挂翁源县乡村振兴局牌子。翁源县委农村工作领导小组办公室是翁源县委农村工作领导小组的办事机构，承担领导小组的日常事务，设在翁源县农业农村局。翁源县农业农村局设下列内设机构：

　　（一）办公室（电话：0751-2872338）；

　　（二）法规与改革股（电话：0751-2829950）；

　　（三）发展规划股（计划财务股）（电话：0751-2861336）；

　　（四）乡村建设和农村社会事业促进股（电话：0751-2873112）；

　　（五）乡村产业发展与农村合作经济指导股（电话：0751-2872720）；

　　（六）帮扶股（革命老区工作办公室）（电话：0751-2861336）；

　　（七）种植业管理与市场信息化股（电话：0751-2872597）；

　　（八）农产品质量安全监管股（电话：0751-2862368）；

　　（九）农田建设管理股（电话：0751-2872586）；

　　（十）科技教育和种业管理股（农业转基因生物安全管理办公室）（电话：0751-2875548）；

　　（十一）执法股（畜牧饲料兽医屠宰渔业与农机管理股）（电话：0751-2875706）；

　　（十二）人事股（电话：0751-2878616）；

　　（十三）机关党委（电话：0751-2865378）。